Saison 3 (Superman & Loïs)

Clark et Lois travaillent désormais ensemble à la Gazette de Smallville et profitent de la vie de la petite ville, tandis que Chrissy s'efforce de trouver un équilibre entre un nouvel intérêt amoureux et son amitié avec Lois. Cependant, l'équilibre entre la vie professionnelle et la vie privée de Lois est mis à l'épreuve lorsqu'une mission d'infiltration révèle un ennemi mortel qui promet de changer la famille Kent pour toujours. Pendant ce temps, John Henry est hanté par le passé de son double, ce qui entraîne des conséquences dangereuses pour lui et Natalie. Lana Lang et Kyle redéfinissent leur famille après leur séparation, tandis que Sarah explore ce que l'avenir lui réserve, à elle et à Jordan, maintenant qu'elle connaît la vérité sur les pouvoirs de ce dernier.

Clark et Chrissy remarquent tous deux que Lois est préoccupée. Pendant ce temps, Sarah et Jordan ont une relation délicate. Enfin, Lana reçoit un appel téléphonique paniqué.

Lois et Chrissy suivent une nouvelle piste dans l'enquête sur Mannheim, contre l'avis de Clark. Pendant ce temps, la tentative de Jonathan, Jordan et Nat de faire un geste bienveillant est compliquée par un obstacle inattendu. Enfin, Lana, Sarah et Kyle s'adaptent à leur nouvelle normalité.

Lois interrompt une conversation intense entre Clark et John Henry. Pendant ce temps, Kyle tente de s'interposer entre Sarah et Lana. Enfin, Jonathan a une discussion animée avec le père de Candice.

Clark et le général Lane ont tous deux du mal à laisser à Lois la possibilité de prendre ses propres décisions. Pendant ce temps, Lana et Sarah rencontrent un vieil ami au restaurant. Enfin, Natalie reçoit une visite surprise.

Clark se retrouve en terrain inconnu et Lois se lie avec une nouvelle amie. Pendant ce temps, Superman rend une visite surprise à Bruno Mannheim. Enfin, Lana laisse Sarah se débrouiller seule pendant qu'elle est absente pour une réunion avec Chrissy.

Lois et Clark approfondissent leurs recherches sur Bruno Mannheim, en commençant par ses liens avec le centre médical de Hob's Bay, tandis que Jonathan et Jordan paniquent à la maison face au diagnostic désastreux de Lois. Pendant ce temps, Matteo vient à Smallville pour rencontrer John Henry pour la première fois, et Sarah et Chrissy commencent à briser la glace.

Après avoir appris que Bruno et Peia sont mariés, Clark s'efforce de raviver l'intérêt de Lois pour l'arrestation de Bruno. Ailleurs, Natalie rencontre les parents de Matteo pour la première fois, ce qui a des conséquences désastreuses. Pendant ce temps, les Kent s'opposent lorsque Jordan interfère avec l'entraînement de Jonathan à la caserne, Lana se lie avec le Général Lane sur leur peur commune de fréquenter quelqu'un à nouveau, et Sarah réalise que sa mère a besoin d'une amie.

Superman et John Henry s'affrontent sur la façon de gérer Bruno Mannheim, tandis que Lois s'inquiète des traitements à venir et se confie à Lana au sujet de sa première cour avec Clark. Pendant ce temps, Jonathan, Jordan et Sarah travaillent ensemble pour aider Natalie à faire face aux conséquences de sa rencontre avec la famille de Matteo.

Lois tente d'interviewer Peia dans l'espoir de découvrir la vérité sur une vieille affaire, tandis que Clark a du mal à passer du bon temps avec les garçons. Pendant ce temps, Jonathan et Jordan se retrouvent à une fête, où les tensions entre Sarah et Jordan atteignent leur paroxysme. Alors que les soupçons de Kyle sur un méta-humain local grandissent, Lana doit jongler avec sa vie personnelle avec la visite du gouverneur. Enfin, Matteo prend une décision qui changera sa vie.

Clark aide Lois à se préparer pour une intervention mais il doit laisser les garçons avec elle pour aider John Henry et le général Lane à retrouver les Mannheim. Pendant ce temps, John Henry et Nat s'opposent à son désir d'aider Matteo, et les plans de Bruno tournent mal à mesure que l'état de Peia s'aggrave.

Lois et Clark se heurtent à Jordan à propos de sa négligence à utiliser ses pouvoirs en public, tandis que Jonathan se débat avec le changement de comportement de Kyle à la caserne des pompiers. Pendant ce temps, Sarah devient frustrée par Lana après avoir accidentellement compliqué les choses avec Jordan. Et enfin, après dix-sept ans derrière les barreaux, Lex Luthor est sur le point de sortir de prison.

Tout Smallville se rassemble pour voir une pluie de météorites, Lex Luthor fait son coup.