Saison 1 (Shades of Blue : une flic entre deux feux)

Inspectrice de police au caractère bien trempé, Harlee Santos n'hésite pas à enfreindre quelques règles pour protéger ses coéquipiers. Mère célibataire, elle considère ses partenaires comme sa seconde famille. Prise en flagrant délit de corruption par le FBI, elle est confrontée lors d'un entretien à l'agent Robert Stahl qui lui propose un marché : fermer les yeux sur son dérapage en échange de sa collaboration en tant qu'informatrice au sein de la brigade anticorruption.

Matt Wozniak est furieux d'apprendre qu'il y a une taupe au sein de son équipe, qui sert d'informateur au FBI. Il soupçonne tous les membres de son groupe. Il confie son désarroi à Santos qui, de son côté, tente de se soustraire à sa mission auprès de Robert Stahl. Pour éloigner les soupçons de son chef, Harlee lui conseille de faire passer toute l'équipe au détecteur de mensonges. De son côté, Carlos Espada soutient du mieux qu'il peut Tess qui a découvert l'infidélité de son mari.

Harlee est arrêtée un matin par des hommes du FBI pour être menée devant l'agente Baker qui a des questions à lui poser sur son supérieur hiérarchique. Wozniak est en effet soupçonné d'accepter des paiements en jetons de casino. L'inspectrice refuse de confirmer ces dires. En revanche, elle accepte d'informer le FBI d'une affaire menée hors des circuits officiels par Tess et Espada. Mais l'enquête se révèle plus complexe qu'elle n'y paraît.

Rongé par la culpabilité et les remords, Michael Loman commence à perdre pied, ce qui inquiète et fragilise l'ensemble de l'équipe. Ses collègues décident de tester sa loyauté de manière brutale. Hospitalisé à la suite d'un accident de voiture, Wozniak donne une mission à Harlee qui se révèle être dangereuse et incriminante. L'inspectrice feint de collaborer avec Stahl mais celui-ci doute de sa sincérité.

A la suite d'une course-poursuite haletante, Harlee et Tess font une importante saisie d'héroïne. La marchandise appartient à Raoul Mendes, un baron de la drogue qui connaît un des secrets les plus intimes de Matt. Donnie reçoit la visite surprise de Robert Stahl qui l'interroge sur Wozniak. Parallèlement, Harlee découvre par inadvertance que Cristina a un petit ami et qu'elle lui ment.

Après que Miguel Zepeda envoie une nouvelle lettre à sa fille, Cristina, Harlee lui rend visite en prison à sa demande. Il est persuadé d'avoir identifié l'homme qui a commis le meurtre pour lequel il est injustement emprisonné. Matt est de son côté persuadé d'avoir identifié la taupe de son équipe : Saperstein. Tess annonce à Carlos qu'elle a l'intention de révéler leur liaison à son mari.

Après sa terrible altercation avec Saperstein qu'il soupçonnait de l'avoir trahi, Wozniak éprouve un profond sentiment de culpabilité. De son côté, Harlee doit répondre aux questions insistantes de Stahl sur le déroulement des événements sur le chantier. Elle décide de couvrir son chef malgré les doutes qui l'assaillent et s'applique à protéger son unité, au bord de l'explosion.

Stahl et son équipe s'interrogent sur les causes exactes de la mort de Saperstein et comptent sur Harlee pour obtenir des aveux de son chef. Toute l'équipe se réunit pour évoquer le décès de son collègue. Wozniak tente d'apaiser les esprits les plus sceptiques tandis qu'Harlee, comprenant qu'il est prêt à tout pour sauver son poste, décide d'aider Stahl dans son enquête. Cristina Santos confie ses problèmes à Tess et Matt.

Après l'émouvant enterrement de Saperstein, Harlee retrouve Stahl à qui elle a promis de l'aide pour faire tomber Matt. Elle retrouve facilement la confiance de son patron et l'accompagne pour la réception d'un colis. Ses investigations mettent au jour la relation secrète qu'entretient Wozniak avec Donnie Pomp. Parallèlement, l'équipe enquête à la suite d'un mystérieux appel téléphonique intercepté sur le poste de Saperstein.

Après avoir découvert la réalité sur la relation qu'entretiennent Wozniak et Donnie, Robert Stahl redouble de détermination pour le confondre. Encore sous le choc, Harlee accompagne son patron lors d'un rendez-vous avec le partenaire de Donnie, qui est agent aux stupéfiants. Miguel Zeppeda sort de prison grâce à un accord passé entre son avocat et le procureur. Il demande à Harlee l'autorisation de rencontrer Cristina.

L'heure du braquage approche et Harlee tente d'obtenir l'immunité pour son équipe en révélant le nom de l'homme à l'origine de cette opération. Mais elle comprend trop tard qu'elle a commis une grave erreur en faisant confiance à Stahl. Miguel Zepeda rencontre en cachette Cristina, qui lui fait des révélations sur le lien qu'entretient sa mère avec Wozniak. Loman assiste malgré lui au braquage orchestré par ses collègues.

Alors qu'ils ont réussi à quitté les lieux du braquage avec l'argent, Harlee et Wozniak sont percutés par une voiture. Lorsqu'ils reprennent connaissance, les billets de banque ont disparu. Matt pense que Donnie les a subtilisés pour régler une importante transaction immobilière. Toujours sur les lieux, Loman est interrogé par le FBI. Se sentant prise au piège, Harlee entre en contact avec l'agent Stahl pour passer un marché avec lui.

Furieuse des nombreux mensonges de sa mère, Cristina se tourne vers son père à qui elle a décidé s'accorder sa confiance. En se rendant chez Wozniak, Loman se retrouve face à Donnie et une violente dispute éclate entre les deux hommes. Lorsqu'il arrive sur place, Matt est contraint de prendre une décision difficile. L'agent Stahl tend un piège à sa coéquipière pour sauver sa carrière.