Saison 3 (FBI Portés Disparus)

L'agent spécial Viviane Johnson (qui remplace Jack à la tête de l'équipe) dirige l'enquête pour retrouver une jeune aveugle et son instructrice parties camper. Jack découvre avec stupéfaction que Maria demande le divorce et la garde de leurs filles.

Sous les ordres de Viviane Johnson, l'équipe recherche une infirmière qui a disparu en rentrant chez elle. Cette dernière, très pratiquante, travaillait au service des grands brûlés. Jack, quant à lui, doit se résoudre à réintégrer l'équipe s'il veut réclamer la garde de ses filles...

L'équipe enquête sur la disparition de Teddy Cota, un homme de 37 ans persuadé d'avoir été enlevé par des extra-terrestres dans sa jeunesse. Depuis quelques temps, il se sentait de nouveau menacé. Jack, lui, se bat pour la garde de ses enfants. Sa femme utilise son histoire avec Samantha pour prouver qu'il n'est pas un bon père.

June, une nounou, disparaît avec l'enfant dont elle a la garde. Jack et son équipe doivent déterminer si elle a été enlevée... ou si elle a kidnappé l'enfant. Les soupçons sont d'abord contre elle : les parents de l'enfant venaient de la renvoyer pour vol. Mais une demande de rançon parvient au FBI, qui concerne la capture de June et de l'enfant.

Lynette Shaw, une Américaine sans charme devenue une superstar grâce au jeu de télé-réalité La Déesse américaine, a disparu. Jack et son équipe découvrent que, malgré les apparences, la jeune célébrité était restée une fille fragile et solitaire. L'enquête s'oriente d'abord vers une des concurrentes du jeu, disqualifiée à cause de Lynette, avant que le soupçons ne se portent sur un ancien prétendant.

L'équipe de Jack Malone est à la recherche d'une jeune maman qui a disparu après avoir confié son petit garçon de trois ans à la baby-sitter. Les détectives dessinent le portrait d'une maman aimante qui, malgré ses deux emplois, a bien du mal à payer la nounou et la chambre de motel où elle vit avec son enfant. Après certaines révélations, ils doivent déterminer si elle a disparu pour fuir son destin ou parce qu'elle était persécutée.

Les recherches pour retrouver Colleen, la jeune maman, conduisent nos agents du FBI sur les traces d'un sale trafic auquel elle semble avoir participé pour réussir à payer son logement. Samantha se propose de servir d'appât afin d'infiltrer le réseau supposé responsable de la disparition de Colleen.

Une SDF disparaît d'un centre d'accueil déjà impliqué dans une précédente affaire. Jack suspecte un des deux jumeaux Knowles.

Peter Dusek, 72 ans, juré dans une affaire criminelle, a disparu. Son absence pourrait bien remettre en cause tout le procès. Jack et son équipe pensent qu'il s'agit d'un enlèvement orchestré par l'accusé. A moins que Peter Dusek n'ait décidé de disparaître de son plein gré...

Dans la bataille pour la garde des enfants, Jack subit de sévères attaques de la part de l'avocat de sa femme sur son travail, son enfance et sa relation avec Samantha.

John et son équipe sont à la recherché de Tara, une brillante étudiante de 16 ans qui a été vue pour la dernière fois par ses amis à un arrêt de bus. Au fil de l'enquête, apparaît derrière la jeune fille parfaite une personne plus complexe qui consommait de la drogue et fréquentait un homme marié...

L'équipe enquête sur James MacAvoy, un détenu qui a disparu lors d'une bagarre dans la cour d'une prison. S'est-il échappé ou a-t-il été victime d'un sinistre complot ? Sa sœur, Laura, penche pour la première hypothèse : Mac avait trouvé Dieu et devait être libéré sur parole dans deux semaines...

Un garçon autiste de 12 ans disparaît au cours d'une sortie de classe au musée. C'est son père qui était en charge du groupe. Des témoins l'ont vu crier sur son fils avant sa disparition. Les soupçons de Jack se portent immédiatement sur lui. Vivian, elle, s'inquiète de l'absence mystérieuse de l'assistante médicale de l'école, et Danny soupçonne un des gardiens qui a des antécédents criminels.

Rosie Diaz, une employée de la poste, a disparu pendant sa tournée. Sa camionnette est retrouvée abandonnée, vidée d'une importante collection de jeux vidéos (d'une valeur de 12 000 dollars). Jack et son équipe se demandent si elle est une victime ou si elle a pris part au cambriolage.

Jack et son équipe enquêtent sur la disparition de Chelsea Prince, une jeune femme célèbre pour ses frasques et sa vie de noctambule. Son chauffeur explique comment la limousine a été coincée et Chelsea extirpée du véhicule. Les ravisseurs créent un site internet où l'on peut voter pour sauver ou non leur victime. Petit à petit l'équipe commence à croire qu'elle a elle-même organisé son enlèvement pour se faire de la publicité.

Martin est désespéré de n'avoir pu empêcher l'enlèvement de Mike, un enfant de douze ans. Mais l'équipe est aidée par la description qu'il a pu faire du ravisseur et de son véhicule. Le policier qui fait traverser les écoliers révèle que ces dernières semaines il a souvent vu Mike avec cet homme...

Jack et son équipe sont à la recherche d'un agent immobilier qui n'est jamais revenu d'un rendez-vous. En enquêtant sur sa disparition, ils découvrent qu'il louait ses biens à des proxénètes...

Stéphanie, chanteuse dans une chorale d'église a disparu. En enquêtant, l'équipe de Jack Malone découvre qu'elle avait récemment demandé à pouvoir interpréter un chant particulier avant de se désister...

L'équipe, très concernée par les graves problèmes de santé de Vivian, se concentre sur une nouvelle affaire : la disparition d'une jeune médium, Agnès. Son associée, Rebecca, a une vision : Agnès serait enfermée à l'arrière d'une camionnette. Jack, Samantha, Martin et Danny ne savent pas quel crédit accorder à cette vision...

Daisy Thorpe, 13 ans, a disparu. Son village, marqué sept ans auparavant par le meurtre irrésolu de la petite Amber, est sous le choc. L'équipe de Jack tente de déterminer si les deux affaires sont liées...

L'équipe aide Danny à chercher Rafael, son frère qu'il n'a plus vu depuis longtemps et qu'il suspecte d'être retourné à ses trafics louches. Danny reste sceptique quand sa belle-sœur lui explique que Rafael a changé, qu'il est devenu un bon père de famille et qu'il va ouvrir une boutique.

Un homme de 71 ans a disparu. La dernière fois qu'il a été vu, il montait dans une voiture avec deux hommes. Par ailleurs, le père de Jack est de retour.

Une jeune femme, Paige Hobson, disparaît sur son lieu de travail. Elle exerçait le métier d'assistante dans un institut d'études de sondage. Quelques minutes plus tôt, son supérieur, M. Ricker, avait reçu la visite de l'inspecteur Baumann qui souhaitait parler à la jeune femme. Lorsque Ricker avait accompagné l'homme jusqu'au bureau de Paige, la jeune femme avait disparu. Paige n'est pas rentrée de la nuit. L'un des collègues de cette dernière la dépeint comme une idéaliste rêvant constamment de changer le monde. Selon lui, son travail actuel la remplissait de dégoût. Malone se renseigne auprès de la police de New York sur l'inspecteur Baumann... qui n'existe pas !